Transformé intérieurement, Ignace poursuit sa convalescence. A peine est-il remis sur pied qu'il décide de quitter Loyola. I1 se rend d'abord à Aránzazu pour y visiter un sanctuaire de la Vierge. De là, il prend la direction de Barcelone.
Drôle d'argument théologique
Chemin faisant, Ignace rencontre un Maure qui lui semble insulter la Vierge Marie en refusant de croire à la naissance virginale de Jésus. Après le départ du Maure, Ignace se demande s'il ne doit pas venger l'honneur de Marie en donnant au Maure " quelques bons coups de poignard ". Indécis, il laisse a sa mule le soin de trancher la question selon qu'elle prendra ou non le même chemin que le Maure. Heureusement, laissée à elle-même, la mule prit la direction opposée.
Après cet épisode, Ignace se procure un manteau de pèlerin et poursuit sa route jusqu'au sanctuaire marial de Montserrat. Notre pèlerin rencontre un bénédictin auquel il fait, longuement et en détail, une confession générale de tous ses péchés passés. Puis à la façon des chevaliers de l'époque, c'est la veillée d'armes à l'autel de Notre-Dame de Montserrat.
Au petit matin, après sa nuit de prière sur la montagne de Montserrat, Ignace se rend à Manrèse où il compte passer quelques jours pour noter des choses dans son cahier. Les quelques jours dureront une année entière.
La solitude Manrèse
À Manrèse, Ignace se retire au fond d'une grotte et il assure sa subsistance en mendiant quotidiennement. Il se livre alors à toutes sortes de pénitences et prie sept heures par jour à genoux. Il tente aussi d'entrer en contact avec des personnes spirituelles ou des ermites qu'il va visiter dans leur solitude. Il ne trouve finalement personne qui puisse l'instruire. Ignace éprouve aussi toutes sortes de mouvements intérieurs, y compris une importante crise de scrupules dont il se sortira grâce à son confesseur, auquel il ouvre entièrement son cour.
Un maître inusité
Après cette crise de scrupules, Ignace a l'impression de sortir d'une longue nuit et de s'éveiller. Dieu devient alors son maître intérieur et, comme dira plus tard Ignace, Dieu l'instruit " comme un maître d'école un enfant ". Si l'époque de Manrèse est marquée de toutes sortes de visions, il faut surtout retenir la grande vision du Cardoner, qui aura une influence déterminante sur toute la vie d'Ignace de Loyola, sur le livre des Exercices spirituels et les Constitutions de la Compagnie de Jésus.
Au terme de cette année-nous sommes en 1523-, Ignace quitte Manrèse pour Barcelone, car il a décidé de se rendre à Jérusalem.